本校正逐步整合陽明及交大兩校區繳費服務趨於一致，提供師生通用且多元的金融服務，消彌地形與付款平台限制之不便。
- 陽明校區111年5月於註冊一組、圖書館、生活輔導一組建置悠遊卡扣款機，以方便學生至臨櫃洽辦時，能一併完成相關繳費，減少來回於各單位與出納一組之洽辦時間。
為提供全校師生便利服務，同時於山上行政大樓及山下傳統醫學大樓之聯合服務中心設置出納服務收費據點，擴大服務鄰近相關單位，藉此解決山區校地之先天不便。
除原於山上知行樓設置之ATM（自動櫃員機）外，另亦於山下新增設一台ATM供師生使用。二台ATM均提供中英文雙語介面，讓外籍生能方便操作使用。
- 交大校區於100年即在校內各行政單位部署悠遊卡扣款機提供師生申請／繳費同一地點一次完成，減少因為繳費須於不同單位間來回奔波，實施成效良好。
另自108年起更進一步推出校園掃碼支付系統，結合街口支付、Line Pay、橘子支付、支付寶等多元支付方式。目前持續推廣QR Code付款機制，像是體育場館設施租賃、圖書館借書逾期罰款或汽機車證申請等皆可使用。另亦於109年度第2學起開放國內外所有外籍生，均可刷國際卡(銀聯卡)繳交學雜分費。
